盐胁迫下盐穗木差异表达基因的转录组信息分析

• 作者: 张富春 王艳 贾富强 赵航
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 盐穗木 盐胁迫 转录组分析 差异表达
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 90-98
• 页数: 9页
• 分类号: Q753
• 字数: 4576字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2014.02.03

摘要

盐穗木是一种理想的耐盐模式植物，本文利用生物信息学方法分析盐穗木在盐胁迫下差异表达基因的转录组，为盐穗木耐盐机理及耐盐关键基因的储备提供理论依据。基于盐穗木在盐胁迫（600 mM NaCl）下差异表达的转录组数据，以代谢通路中基因表达数量最多的7条通路和与胁迫刺激响应相关的共8条通路为主要研究内容，筛选出上调和下调表达差异显著的unigene，将其与NCBI数据库中所有物种相关基因进行Blastx比对，筛选出通路中上调和下调差异表达最显著的unigene，同时对差异表达活跃的unigene进行分类汇总。共得到23组差异表达活跃的基因类群，分别是乙烯响应因子、WRKY转录因子、Myb转录因子、bZIP转录因子、葡聚糖酶、6-磷酸脱氢酶、醛脱氢酶、柠檬酸合成酶、蛋白激酶等，推测这些类群的基因在盐穗木耐盐机制中发挥重要作用。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张富春	新疆大学生命科学与技术学院新疆生物资源与基因工程重点实验室	286	2034	23.0	31.0
2	王艳	新疆大学生命科学与技术学院新疆生物资源与基因工程重点实验室	32	254	8.0	15.0
3	赵航	新疆大学生命科学与技术学院新疆生物资源与基因工程重点实验室	4	23	1.0	4.0
4	贾富强	新疆大学生命科学与技术学院新疆生物资源与基因工程重点实验室	1	23	1.0	1.0