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番茄SlDP1基因的克隆、生物信息学及表达特性分析
番茄SlDP1基因的克隆、生物信息学及表达特性分析
作者:
张建苓
杜利欣
胡宗利
陈国平
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
SlDP1基因
生物信息学分析研究
表达模式
激素处理
非生物环境胁迫
摘要:
DP基因属于DP/E2F转录因子家族,其编码的蛋白是E2F蛋白的二聚化分子伴侣,可能参与调控细胞周期、DNA复制、生长、分化、凋亡等多种细胞进程.根据SGN数据库登录的番茄序列,通过RT-PCR方法从野生型番茄中克隆了一个DP基因,命名为SlDP1.生物信息学预测,S1DP1蛋白定位于细胞核,具有保守的DNA结合域、二聚化区域和C-末端及多个磷酸化位点.蛋白质二级结构预测S1DP1蛋白含51.50%的环状结构,34.55%的α螺旋和2.66%的β折叠.荧光定量PCR分析外源激素对野生型番茄SlDP1基因表达量的影响,发现该基因受外源性乙烯前体ACC的诱导.对环境因子应答的RT-PCR结果表明,在伤害和盐处理的叶中该基因表达不受诱导,而盐处理的根中该基因表达量提高.SlDP1基因表达模式分析表明,该基因在根、花、萼片及成熟时期果实中表达量较高.这些结果为进一步研究SlDP1基因在番茄生长发育过程的功能奠定了基础.
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文献信息
篇名
番茄SlDP1基因的克隆、生物信息学及表达特性分析
来源期刊
植物研究
学科
生物学
关键词
SlDP1基因
生物信息学分析研究
表达模式
激素处理
非生物环境胁迫
年,卷(期)
2014,(1)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
68-74
页数
7页
分类号
Q786
字数
语种
中文
DOI
10.7525/j.issn.1673-5102.2014.01.010
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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1
胡宗利
53
641
12.0
24.0
2
陈国平
56
671
12.0
25.0
3
张建苓
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杜利欣
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生物信息学分析研究
表达模式
激素处理
非生物环境胁迫
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研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
植物研究
主办单位:
东北林业大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1673-5102
CN:
23-1480/S
开本:
大16开
出版地:
哈尔滨市和兴路26号东北林业大学
邮发代号:
14-77
创刊时间:
1959
语种:
chi
出版文献量(篇)
2736
总下载数(次)
1
相关基金
重庆市自然科学基金
英文译名:
官方网址:
http://law.ddvip.com/law/2006-09/11584979384040.html
项目类型:
重点项目
学科类型:
期刊文献
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