药用植物灯盏花rbcL基因的克隆、生物信息学及适应性进化分析

• 作者: 张维汉 熊勇 赵春艳 高兴艳
• 来源期刊: 生物技术
• 学科: 医学
• 关键词: 灯盏花 rbcL基因克隆 生物信息学分析 适应性进化分析
• 年，卷（期）: 2014,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 25-31
• 页数: 7页
• 分类号: Q785|R318.04
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-311X.2014.03.0056

摘要

目的:克隆药用植物灯盏花叶绿体rbcL基因,该基因编码二磷酸核酮糖羧化酶大亚基,并对该基因序列、蛋白质特性和适应性进化进行分析.方法:根据相关文献设计引物,利用PCR方法扩增并克隆完整rbcL基因序列,对rbcL蛋白进行结构建模和评价.结果:灯盏花rbcL基因长度为1 458bp,编码485氨基酸(GenBank登录号为KF482865).通过与GenBank库中Erigeron tenuis氨基酸序列比较相似性超过95％.RbcL蛋白二级结构含有21个α-helices、7个β-sheets和一些卷曲.通过适应性进化分析在rbcL蛋白上有3个氨基酸正选择位点(76 E、131 Q和422 E).结论:灯盏花rbcL基因的完整克隆有助于更深的研究灯盏花对特殊生境的适应,rbcL蛋白大亚基正选择位点的空间结构对于维持核酮糖结构具有重要的作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵春艳		20	128	5.0	11.0
2	熊勇		1	0	0.0	0.0
3	高兴艳		1	0	0.0	0.0
4	张维汉		1	0	0.0	0.0