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摘要:
为了提高茶树 SNPs 分型效率,促进 SNPs 在茶树遗传育种中的应用,研究了 SNaPshot 技术进行茶树SNPs分型的可行性。从实验室前期确证的SNPs中,选择10个作为目标SNPs;使用SNaPshot技术在不同的茶树品种中进行分型;然后,对分型结果进行比对和统计,以验证 SNaPshot 技术检测茶树 SNPs 的准确性、重复性以及在茶树遗传多样性分析等方面的可用性。结果发现,6个 SNPs分型结果与测序结果一致,准确率为60%;目标SNPs在龙井43及其重复实验中的分型结果完全一致;6个SNPs的等位基因数都是2,期望杂合度(He)介于0.37~0.52,观测杂合度(Ho)介于0.32~0.74,多态性信息含量(PIC)介于0.36~0.50;结果表明,SNaPshot技术对茶树SNPs的分型准确性高、重复性好,可以用于茶树遗传多样性分析以及茶树遗传图谱构建等方面的研究。
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文献信息
篇名 SNaPshot技术检测茶树SNP研究
来源期刊 茶叶科学 学科 农学
关键词 茶树 SNPs SNaPshot 遗传多样性 遗传图谱
年,卷(期) 2014,(2) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 180-187
页数 8页 分类号 S571.1|Q52
字数 3752字 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 成浩 中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心 59 991 19.0 29.0
2 王丽鸳 中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心 36 354 11.0 18.0
3 张成才 中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心 6 63 5.0 6.0
4 韦康 中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心 22 144 7.0 11.0
5 谭礼强 中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心 17 33 4.0 5.0
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SNaPshot
遗传多样性
遗传图谱
研究起点
研究来源
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
茶叶科学
双月刊
1000-369X
33-1115/S
大16开
浙江省杭州市梅灵南路9号
1964
chi
出版文献量(篇)
1649
总下载数(次)
7
总被引数(次)
35563
相关基金
浙江省自然科学基金
英文译名:
官方网址:http://www.zjnsf.net/
项目类型:一般项目
学科类型:
论文1v1指导