牦牛FSHR基因5'端部分序列克隆及生物信息学分析

• 作者: 李雯 柴志欣 罗虹 钟金城
• 来源期刊: 家畜生态学报
• 学科: 农学
• 关键词: 牦牛 FSHR 基因克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 科学研究
• 页码范围: 15-20
• 页数: 6页
• 分类号: S811.6
• 字数: 4010字
• 语种: 中文

摘要

利用PCR和T-A克隆技术,测定了麦洼牦牛和杂种犏牛的FSHR基因5 '端侧翼区和第1外显子的核苷酸序列,并运用BLAST、DNAMAN、Clustal等生物信息学软件与其他物种的相应序列进行了同源性比对分析,为牦牛FSHR基因结构、犏牛雄性不育、牦牛遗传多样性,以及FSHR基因与牦牛的繁殖、产肉、产奶性状相关分析提供了理论基础.结果表明:牦牛和犏牛FSHR基因5 '端侧翼区长度为970 bp,普通牛、羊和猪的该序列长度分别为970、973和981 bp,序列长度差异较小;序列突变以碱基替换为主,牦牛与犏牛、普通牛、羊及猪的核苷酸序列一致性分别为99.4％、99.3％、98.2％、96.9％,一致性较高,为同源基因.聚类分析中牦牛与犏牛首先相聚,再依次与普通牛、羊、猪聚在一起.根据核苷酸序列推测,氨基酸组成分析显示,牦牛和犏牛的该蛋白疏水性,蛋白的亲水性和稳定性较差,为不稳定的脂溶性蛋白;二级结构主要以α螺旋和随机卷曲为主.