桃2个endo-PG基因序列SNPs的遗传多样性及其与果实黏离核性状的关联分析

• 作者: 方伟超 曹珂 朱更瑞 王力荣 王新卫 陈昌文 麻国升
• 来源期刊: 果树学报
• 学科: 农学
• 关键词: 桃 遗传多态性 endo-PG基因 黏离核 关联分析
• 年，卷（期）: 2014,（3）
• 所属期刊栏目: 种质资源·遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 345-352
• 页数: 8页
• 分类号: S662.1
• 语种: 中文

摘要

[目的]解析桃果实黏离核性状的分子机制.[方法]以不同黏离核性状的45份桃野生资源、地方品种和育成品种为试材,采用第2代测序技术鉴定2个通过连锁分析得到的、串联重复的endo-PG基因在45份种质中的SNPs(single nucleotide polymorphisms)信息;继而采用GLM (Generalized Linear Models)和MLM (Mixed Linear Models)模型进行关联分析,鉴定与黏离核性状关联的SNPs.[结果]在ppa006839m和ppa006857m这2个endo-PG基因内共鉴定到98个SNPs,平均1 SNPs/59 bp.在少数位点上,离核和黏核种质的SNPs多态性存在差异,但整体多样性水平差异不显著,暗示这2个endo-PG基因倾向于中性进化.根据98个SNPs位点信息构建的系统发育树能够反映这些种质的进化关系,即光核桃、甘肃桃最为原始,山桃其次,普通桃最为进化.GLM关联分析结果表明,在ppa006839m基因的内含子3区存在一个与黏离核性状显著关联的位点,对表型变异的解释率为21.1％,但经Bonferroni多重检验校正后,该位点并无统计学意义.而MLM模型的关联分析并没有检测到显著关联位点.[结论]研究结果虽然没能解释果实黏离核的分子机制,但暗示ppa006839m可能与该性状存在更为紧密的联系.同时,研究结果也为果实黏离核性状的分子标记辅助育种奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱更瑞	中国农业科学院郑州果树研究所	100	1152	18.0	32.0
2	方伟超	中国农业科学院郑州果树研究所	86	1144	18.0	32.0
3	陈昌文	中国农业科学院郑州果树研究所	45	316	9.0	17.0
4	王力荣	中国农业科学院郑州果树研究所	95	1266	20.0	34.0
5	曹珂	中国农业科学院郑州果树研究所	50	346	10.0	18.0
6	王新卫	中国农业科学院郑州果树研究所	30	44	4.0	6.0
7	麻国升	中国农业科学院郑州果树研究所	2	0	0.0	0.0