草菇基因组中11个漆酶同源基因的生物信息学分析及铜离子对其表达的影响

• 作者: 吴林 朱刚 汪虹 陈明杰 鲍大鹏
• 来源期刊: 菌物学报
• 关键词: 草菇 漆酶基因 铜离子 表达
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 323-333
• 语种: 中文
• DOI: 10.13346/j.mycosystema.130231

摘要

通过分析草菇基因组中11个漆酶同源基因所编码的蛋白的性质、转录调控元件和测定铜离子存在条件下的草菇漆酶活性及11个漆酶基因的转录水平,揭示了草菇漆酶基因的各自特性、差异以及基因功能与进化机制.分析表明,这11个漆酶同源基因编码的蛋白具有508-562aa个氨基酸,分子量和理论等电点分别为56.25-60.75kDa和4.51-6.18(未经翻译后修饰),且都具有真菌漆酶铜离子结合区域的特征序列、4个能够结合催化底物的环形结构以及信号肽序列,都属于分泌性的胞外蛋白,但其底物结合位点数目、loop序列的一致性、跨膜区域数目和位置以及信号肽位置等存在较大差异.草菇11个漆酶起始密码子上游2 000bp的序列中含有真核生物的基本转录调控元件(TATA-box,CAAT-box及GC-box)和多个潜在的调控元件(MRE、XRE、STRE、HSE、ARE、TRE、NIT元件等),但每个基因所含调控元件数目及种类各有不同.在液体培养条件下,铜离子能够诱导除vv-lac2、vv-lac3和vv-lac7之外的其余8个草菇漆酶基因的表达,且适宜浓度的铜离子有助于草菇漆酶活性的增加.