铜胁迫下小白菜叶片基因表达谱的cDNA-AFLP分析

• 作者: 叶丽萍 林义章 林俊芳 赵瑞丽 钟凤林 高世超
• 来源期刊: 中国生态农业学报(中英文)
• 关键词: 小白菜 铜胁迫 基因表达谱 cDNA-AFLP
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 480-490
• 页数: 11页
• 分类号: S634.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1011.2014.30985

摘要

本研究以小白菜品种‘上海青’为试验材料,利用Cu2+质量浓度为10 mg·L-1的营养液水培小白菜幼苗,通过cDNA-AFLP技术分析小白菜响应铜胁迫相关基因及其表达情况.试验中利用多态性较好的135对引物进行扩增,共获得5 800多条转录衍生片段(TDFs),平均每个引物组合扩增出30～60条,片段大小主要集中在100～1 000 bp,根据条带强弱和有无的变化,其表达模式可以分为持续表达、瞬时表达、上调表达和下调表达4种情况.通过筛选获得180条差异表达TDFs,其中上调表达77条(42.8％),下调表达61条(33.9％),瞬时表达42条(23.3％).选取其中152条差异表达TDFs进行回收测序,最终得到151个有效序列,其中上调表达68条(45％),下调表达50条(33.1％),瞬时表达33条(21.9％).Blastx比对结果显示,112条TDFs序列与已知基因具有较高的相似度,涉及能量代谢、物质合成与运输、逆境响应、信号转导等多种途径,16条TDFs序列与功能未知或假定基因的同源性较高,其余23条TDFs序列与已知功能基因的同源性较低或零匹配,可能是一些新的铜胁迫应答基因.从151条TDFs选取4条TDFs,以小白菜actin基因为内参照,对其在不同胁迫处理时间的表达情况进行荧光定量RT-PCR验证,分析结果与cDNA-AFLP结果基本吻合,表明cDNA-AFLP技术是研究小白菜铜胁迫相关基因差异表达的有效方法.小白菜铜胁迫相关基因表达情况较为复杂,涉及多种代谢途径.本研究结果可为探讨小白菜铜胁迫的分子机理和相关基因的克隆提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	钟凤林	福建农林大学园艺学院	92	414	11.0	14.0
2	林义章	福建农林大学园艺学院	77	941	15.0	27.0
3	赵瑞丽	福建农林大学园艺学院	9	29	4.0	5.0
4	高世超	福建农林大学园艺学院	9	29	4.0	5.0
5	林俊芳	福建农林大学园艺学院	8	39	4.0	6.0
6	叶丽萍	福建农林大学园艺学院	6	23	3.0	4.0