花椒茎尖节点转录组测序及基因注释

• 作者: 代惠萍 杨途熙 蒋弘刚 魏安智
• 来源期刊: 西北林学院学报
• 关键词: 花椒 皮刺分化 转录组 高通量测序
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 所属期刊栏目: 林木遗传育种与培育
• 页码范围: 94-99
• 页数: 6页
• 分类号: S722.39
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-7461.2014.06.18

摘要

花椒茎枝有尖锐皮刺,在实际生产中增加采摘成本,并降低采摘效率.为培育品质优良的无刺品种,筛选皮刺分化的关键基因具有重要意义.使用二代高通量测序技术对花椒皮刺起始分化的茎尖节点组织转录组进行测序,使用生物学软件对原始数据进行拼装,最终获得45 057条转录本序列.使用比对工具将得到的转录本与Swiss-Prot,NR,Pfam,KEGG,KOG数据库比对后,80.34％的转录本序列至少被一个数据库注释.获取的大量的基因序列及注释信息为进一步探究花椒皮刺分化分子机理提供了良好的基础,为定位皮刺分化关键基因提供依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	魏安智	西北农林科技大学林学院	81	1059	18.0	28.0
2	杨途熙	西北农林科技大学林学院	70	956	17.0	28.0
3	蒋弘刚	西北农林科技大学林学院	2	27	2.0	2.0
4	代惠萍		16	71	6.0	8.0