SSR在黑木耳和毛木耳转录组中的分布和序列特征

• 作者: 周雁 范秀芝 边银丙 陈连福
• 来源期刊: 菌物学报
• 关键词: 黑木耳 毛木耳 转录组 简单重复序列 基序
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 280-288
• 语种: 中文
• DOI: 10.13346/j.mycosystema.120294

摘要

以黑木耳和毛木耳转录组测序获得的转录本序列为基础,采用软件SSR Locator对两个物种中SSR的数量、分布和结构特征等方面进行分析,发现毛木耳中SSR的丰度和密度较黑木耳小.在两者的SSR中,三碱基和六碱基重复的出现最多.对含量最多的三碱基重复序列的基序进行分析表明富含GC的SSR在这两个种的转录组中占优势地位.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	边银丙	华中农业大学应用真菌研究所	121	1206	20.0	27.0
2	范秀芝	华中农业大学应用真菌研究所	3	34	3.0	3.0
3	周雁	华中农业大学应用真菌研究所	13	72	5.0	8.0
4	陈连福	华中农业大学应用真菌研究所	1	15	1.0	1.0