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摘要:
目的:探讨结直肠癌中长链基因间非编码RNAs(long intergenic non-coding RNAs,lincRNAs)的表达特征.方法:采用基因芯片技术检测4例结直肠癌及癌旁正常黏膜组织中长链非编码RNAs (long non-coding RNAs,IncRNAs)与mRNAs的表达情况,筛选出差异表达的lincRNAs与mRNAs并用MeV 4.6软件行聚类分析;进一步采用上海伯豪生物技术有限公司的生物芯片分析系统(SBC Analysis System,SAS)分析其相关信号转导通路;采用实时荧光定量-PCR方法验证linc-UCC、linc-DCC与MIR143HG在癌组织及癌旁组织中的表达情况,并分析与结直肠癌临床特征之间的相关性.结果:采用基因芯片共检测到42 545个RNA,其中124个lincRNAs和1 583个mRNAs的表达有明显差异.生物信息学分析结果显示,有29条信号转导通路可能与这些lincRNAs有关.linc-UCC在较多结直肠癌组织中表达增多,其高表达与肿瘤淋巴结转移密切相关;而linc-DCC与MIR143HG在多数结直肠癌组织中表达减少,二者呈正相关性.结论:通过基因芯片技术筛选获得与结直肠癌相关的lincRNAs,以期为结直肠癌的临床诊断及治疗提供一些新的靶点.
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文献信息
篇名 结直肠癌中lincRNAs表达特征的初步研究
来源期刊 肿瘤 学科 医学
关键词 结直肠肿瘤 长链非编码RNA 芯片分析技术 系统生物学
年,卷(期) 2014,(3) 所属期刊栏目 临床研究
研究方向 页码范围 245-252
页数 8页 分类号 R735.34
字数 语种 中文
DOI 10.3781/j.issn.1000-7431.2014.03.008
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研究主题发展历程
节点文献
结直肠肿瘤
长链非编码RNA
芯片分析技术
系统生物学
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
肿瘤
月刊
1000-7431
31-1372/R
大16开
上海市斜土路2200弄25号
4-289
1981
chi
出版文献量(篇)
4424
总下载数(次)
6
相关基金
广东省自然科学基金
英文译名:Guangdong Natural Science Foundation
官方网址:http://gdsf.gdstc.gov.cn/
项目类型:研究团队
学科类型:
论文1v1指导