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结直肠癌中lincRNAs表达特征的初步研究
结直肠癌中lincRNAs表达特征的初步研究
作者:
古志强
唐健
姚和瑞
庄燕妍
张世能
彭娟菲
黄凤婷
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
结直肠肿瘤
长链非编码RNA
芯片分析技术
系统生物学
摘要:
目的:探讨结直肠癌中长链基因间非编码RNAs(long intergenic non-coding RNAs,lincRNAs)的表达特征.方法:采用基因芯片技术检测4例结直肠癌及癌旁正常黏膜组织中长链非编码RNAs (long non-coding RNAs,IncRNAs)与mRNAs的表达情况,筛选出差异表达的lincRNAs与mRNAs并用MeV 4.6软件行聚类分析;进一步采用上海伯豪生物技术有限公司的生物芯片分析系统(SBC Analysis System,SAS)分析其相关信号转导通路;采用实时荧光定量-PCR方法验证linc-UCC、linc-DCC与MIR143HG在癌组织及癌旁组织中的表达情况,并分析与结直肠癌临床特征之间的相关性.结果:采用基因芯片共检测到42 545个RNA,其中124个lincRNAs和1 583个mRNAs的表达有明显差异.生物信息学分析结果显示,有29条信号转导通路可能与这些lincRNAs有关.linc-UCC在较多结直肠癌组织中表达增多,其高表达与肿瘤淋巴结转移密切相关;而linc-DCC与MIR143HG在多数结直肠癌组织中表达减少,二者呈正相关性.结论:通过基因芯片技术筛选获得与结直肠癌相关的lincRNAs,以期为结直肠癌的临床诊断及治疗提供一些新的靶点.
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文献信息
篇名
结直肠癌中lincRNAs表达特征的初步研究
来源期刊
肿瘤
学科
医学
关键词
结直肠肿瘤
长链非编码RNA
芯片分析技术
系统生物学
年,卷(期)
2014,(3)
所属期刊栏目
临床研究
研究方向
页码范围
245-252
页数
8页
分类号
R735.34
字数
语种
中文
DOI
10.3781/j.issn.1000-7431.2014.03.008
五维指标
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长链非编码RNA
芯片分析技术
系统生物学
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
肿瘤
主办单位:
上海市肿瘤研究所
上海交通大学医学院附属仁济医院
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-7431
CN:
31-1372/R
开本:
大16开
出版地:
上海市斜土路2200弄25号
邮发代号:
4-289
创刊时间:
1981
语种:
chi
出版文献量(篇)
4424
总下载数(次)
6
相关基金
广东省自然科学基金
英文译名:
Guangdong Natural Science Foundation
官方网址:
http://gdsf.gdstc.gov.cn/
项目类型:
研究团队
学科类型:
期刊文献
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