CODEHOP RT-PCR技术在黄病毒属病毒筛查中应用

• 作者: 孙肖红 胡群 郑剑宁 韩辉 马思杰
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: 黄病毒 检测 CODEHOP RT-PCR
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 简报
• 页码范围: 171-176
• 页数: 6页
• 分类号: R373.9
• 语种: 中文

摘要

为了探讨CODEHOP RT-PCR技术在黄病毒属病毒筛查中的应用效果,根据GenBank发表的不同黄病毒多聚蛋白氨基酸序列,利用CODEHOP方法设计合成一对简并引物,用一步RT-PCR对乙型脑炎病毒株JEV1201、登革热病毒株JKD001和黄热疫苗YV6161进行检测,扩增产物测序后进行BLAST同源性比对和系统分生分析.结果显示该方法可以特异的对黄病毒进行扩增,目的片段的大小和序列与预期结果相符,JEV1201与乙脑病毒株YL2009-4/YC2009-3同源性最为接近,位于乙脑病毒株进化树分支.JKD001与登革热病毒株DENV-2/ID/1022DN/1975同源性最为接近,位于登革热病毒株进化树分支.YV6161与黄热病病毒株17D同源性最为接近,位于黄热病病毒株进化树分支.由此可知CODEHOP RT-PCR技术可以被有效的用于对黄病毒属病毒的筛查、种类鉴定和分子溯源.