高通量测序技术研究棉蚜携带病毒种类

• 作者: 吕丽敏 崔金杰 张帅 李春花 王春义 雒珺瑜
• 来源期刊: 棉花学报
• 学科: 农学
• 关键词: 棉蚜 病毒 高通量测序 基因组 转录组
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 所属期刊栏目: 研究与进展
• 页码范围: 539-545
• 页数: 7页
• 分类号: S435.622
• 字数: 4834字
• 语种: 中文

摘要

棉蚜是传播寄主植物病毒的主要昆虫媒介,但对棉蚜携带的病毒种类及病毒基因组序列信息了解较少.本文利用高通量测序技术,对棉蚜田间自然种群所携带的病毒基因序列进行发掘、鉴定和分类.通过对田间苗蚜和伏蚜转录组数据进行分析,获得18种病毒基因组序列,其中17种病毒为未报道过基因组信息的种类.在18种病毒中,有13种为正链RNA病毒.苗蚜携带病毒的种类和数量都远远高于伏蚜,苗蚜携带全部的18种病毒;伏蚜仅携带8种,而且携带病毒的FPKM(Fragments per kb per million fragments)值较低.本研究丰富了棉蚜所携带的病毒基因组信息,为棉蚜传毒机制研究打下基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	崔金杰	棉花生物学国家重点实验室/中国农业科学院棉花研究所	6	19	3.0	4.0