鳗鲡目鱼类线粒体蛋白质编码基因易位及系统演化关系分析

• 作者: 孟学平 田美 申欣 程汉良 阎斌伦
• 来源期刊: 海洋学报（中文版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 鳗鲡 蛋白质编码基因 基因易位 系统演化关系
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 73-81
• 页数: 9页
• 分类号: Q959.46+9
• 字数: 5967字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0253-4193.2014.04.009

摘要

鳗鲡目鱼类线粒体基因组的基因组成较为保守,在58个线粒体基因组中,仅有3个物种存在基因数量的差异.在19个鳗鲡目鱼类线粒体基因组中存在主编码基因的重排.主编码基因的变异位点分析结果支持nad5、had4和had2基因作为cox1和lrRNA基因辅助的分子标记.鳗鲡科Anguillidae的20个种(亚种)聚在一起,强烈支持鳗鲡科为单系群(BPP=100).鳗鲡科下属的3个类群(大洋洲类群、大西洋类群和印度洋太平洋类群)也同时得到有力的验证(BPP均为100).线鳗科Nemichthyidae和锯齿鳗科Serrivomeridae亲缘关系最近,二者聚类后,与鳗鲡科Anguillidae构成姊妹群(BPP=100).在囊喉鱼亚目Saccopharyngoidei中,宽咽鱼科Eurypharyngidae与囊鳃鳗科Saccopharyngidae聚类(BPP=100),同时,单颌鳗科Monognathidae与月尾鳗科Cyematidae聚类(BPP=100),4个科聚在一支,支持囊喉鱼亚目为单系群(BPP=100).在囊喉鱼亚目线粒体基因组中,3个物种(吞鳗Eurypharynx pelecanoides、拉文囊鳃鳗Saccopharynxla venber gi和杰氏单颌鳗Monognathus jesperseni)存在主编码基因的重排.16种鳗鲡(细美体鳗Ariosoma shiroanago、短吻颈鳗Derichth ys serpentinus、凯氏短尾康吉鳗Coloconger cadenati、鸭颈鳗Nessorhamphus ingol fianus、龟草鳗Thalassenchelys sp.、粗犁齿海鳗Cynoponticus erox、百吉海鳗Muraenesox bagio、巨斑花蛇鳗Myrichth ys maculosus、大吻沙蛇鳗Ophisurus macrorh ynchos、几内亚副康吉鳗Paraconger notialis、哈氏异康吉鳗Heteroconger hassi、小头鸭嘴鳗Nettastoma parviceps、弱头鳗Leptocephalus sp.、斑点长犁齿鳗Hoplunnis punctata、尖吻小鸭嘴鳗Facciolella oxyrh yncha和星康吉鳗Congerm yriaster),与鳗鲡目线粒体主编码基因的原始排列相比,共享had6基因的易位.同时,基于线粒体基因组13个蛋白质编码基因构建的系统演化树,强烈支持这16个物种聚为一支(BPP=100).然而,由此而带来的海鳗科Muraenesocidae、拟鯙科Chlopsidae和糯鳗科Congridae是否为单系群的问题,值得今后深入探究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	申欣	淮海工学院海洋学院江苏省海洋生物技术重点实验室	37	175	8.0	11.0
5	田美	淮海工学院海洋学院江苏省海洋生物技术重点实验室	24	134	7.0	10.0
6	孟学平	淮海工学院海洋学院江苏省海洋生物技术重点实验室	46	339	11.0	15.0
7	程汉良	淮海工学院海洋学院江苏省海洋生物技术重点实验室	62	727	14.0	24.0
8	阎斌伦	淮海工学院海洋学院江苏省海洋生物技术重点实验室	264	2463	24.0	36.0