全外显子测序结合先天性心脏病相关基因过滤在一家族性房间隔缺损家系中检测出新的致病

• 来源期刊: 浙江大学学报（英文版）（B辑：生物医学和生物技术）
• 学科: 生物学
• 关键词: 组:先天性心脏病 房间隔缺损 全外显子测序 先天性心脏病相关基因 TBX20
• 年，卷（期）: 2014,（9）
• 页码范围: 830-837
• 页数: 8页
• 分类号: Q987
• 语种: 英文
• DOI: 10.1631/jzus.B1400062

摘要

研究目的：寻求该房间隔缺损家系遗传致病原因。<br>　　创新要点：1．鉴定出一个全新的家族性房间隔缺损相关性TBX20突变；2．首次使用全外显子测序结合先天性心脏病相关基因过滤的方法来研究小家系遗传致病因素；3．TBX20的T-box DNA结合域的突变与先天性心脏病有关。<br>　　研究方法：对一个临床发现的房间隔缺损家系（图1a）的先证者进行全外显子测序，运用公共数据库过滤后，使用先天性心脏病相关基因再次过滤，得到了19个候选基因；然后，运用 SIFT、Polyphen-2和MutationTaster等软件预测，排除了13个多态性位点（表2）；最后，运用共分离检测（聚合酶链式反应产物直接测序），找到该家系致病的遗传因素，即TBX20基因发生了错义突变（D176N）（图2），该突变位点在ESP和dbSNP数据库中也未曾发现，且该位点在多种生物中高度保守（图1c）。<br>　　重要结论：1．本研究发现的 TBX20突变（D176N）是该房间隔缺损家系致病的原因，同时该突变位点为世界上首次报道；2．全外显子测序结合先天性心脏病相关基因过滤是一个分析小家系遗传致病因素的有效又经济的方法。