慈竹LEAFY基因和启动子的克隆及序列分析

• 作者: 于丽霞 孙晓娇 白琼 鄢波
• 来源期刊: 竹子学报
• 关键词: 慈竹 LFY基因 克隆 启动子 系统进化树
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 页码范围: 16-24
• 页数: 9页
• 语种: 中文

摘要

研究以开花慈竹叶片为材料,采用RT-PCR、染色体步移和RACE相结合的方法克隆得到慈竹LFY基因的完整片段,该基因DNA全长为3 116 bp,包含5'UTR和3'UTR,3个外显子和2个内含子序列,有一个1 161 bp的完整开放阅读框,编码386个氨基酸,LFY蛋白相对分子质量为42.29 kDa,等电点为8.85.蛋白质二级结构预测发现α-螺旋结构和无规卷曲为主导.通过Tail-PCR技术克隆得到1 003 bp的慈竹LFY基因的启动子序列,包含花粉特异表达元件、种子特异表达元件、激活StDofl蛋白在保卫细胞特异表达元件、控制大豆胁迫下的应答元件MYC识别位点、光调节相关元件及AGL15结合位点保守元件等.利用MAGA5.1软件构建慈竹与44种已知的不同植物来源的LFY基因氨基酸序列的系统发育树,结果显示系统发育树中分为2个大的分支,其中裸子植物和蕨类植物遗传距离较近,禾本科植物中慈竹与玉米遗传距离较近,其次为小麦.该研究从慈竹中克隆得到与花分生组织形式相关基因LFY基因,该研究为今后从分子水平上研究竹类植物开花机理打下基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	于丽霞	西南林业大学园林学院	14	38	4.0	5.0
2	鄢波	西南林业大学园林学院	22	46	4.0	6.0
3	孙晓娇	西南林业大学园林学院	4	14	2.0	3.0
4	白琼	西南林业大学园林学院	6	27	4.0	5.0