太平洋牡蛎不同组织DNA甲基化的F-MSAP分析

• 作者: 于红 姜群 孔令锋 李琪
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 太平洋牡蛎 基因组 甲基化 F-MSAP
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 676-683
• 页数: 8页
• 分类号: S917
• 字数: 5144字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2014.00676

摘要

采用荧光标记的甲基化敏感性扩增多态性(F-MSAP)技术对太平洋牡蛎(Crassostrea gigas)的6个组织进行全基因组CCGG位点甲基化水平的检测。结果表明：鳃、闭壳肌、外套膜、唇瓣、性腺、消化盲囊6个组织的甲基化水平分别为：31.77%、36.41%、32.00%、36.47%、32.77%和37.92%。甲基化模式分为全甲基化和半甲基化，在太平洋牡蛎中，全甲基化模式与总体甲基化水平一致，消化盲囊、唇瓣、闭壳肌组织的甲基化水平较高，而鳃、外套膜、性腺组织的甲基化程度较低；半甲基化位点显著少于全甲基化位点，并且不同组织间的半甲基化位点不存在显著性差异，而从全甲基化位点及总甲基化水平分析，不同组织之间甲基化水平差异显著。太平洋牡蛎中存在组织特异性甲基化片段和非组织特异性甲基化片段，但却只在一个或部分个体中出现，没有发现在所有研究个体中都存在的甲基化差异片段，这可能与牡蛎较高的杂合度相关。对实验样品进行的荧光标记的扩增片段长度多态性(F-AFLP)分析发现，样品间的确存在较大的遗传差异，基于以上结果可以推测基因组甲基化水平可能与个体遗传背景相关联。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李琪	中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室	152	1522	20.0	31.0
2	孔令锋	中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室	79	808	16.0	24.0
3	于红	中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室	49	498	12.0	20.0
4	姜群	中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室	2	21	2.0	2.0