杨树扩展蛋白基因家族的生物信息学分析

• 作者: 丁亚娜 徐吉臣 施杨 李昊阳
• 来源期刊: 北京林业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 杨树 扩展蛋白 细胞壁 基因家族 生物信息学
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 林学
• 页码范围: 59-67
• 分类号: S792.11|Q943.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.13332/j.cnki.jbfu.2014.02.014

摘要

扩展蛋白是植物细胞壁的重要组成部分,广泛存在于植物基因组中,具有疏松细胞壁组分、增加细胞壁柔韧性的作用,在植物的生长发育及抗性等多个方面起着重要的作用.全基因组序列分析显示,杨树中的扩展蛋白基因家族包含36个成员,分属于EXPA、EXPB、EXLB和EXLA 4个亚家族.系统生物信息学分析表明,杨树扩展蛋白基因具有保守的序列特征和稳定的蛋白结构,包括9种不同的内含子起源模式以及6个高频密码子.基因表达分析显示,该家族基因在杨树木材形成相关的组织/器官中表达丰度较高,对林木生殖发育也起着重要的作用.研究结果展示了杨树扩展蛋白基因家族的基本信息和特点,为深入研究杨树扩展蛋白基因的功能搭建平台.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐吉臣	北京林业大学林木育种国家工程实验室	11	66	5.0	8.0
2	施杨	北京林业大学林木育种国家工程实验室	3	23	2.0	3.0
3	李昊阳	北京林业大学林木育种国家工程实验室	4	51	3.0	4.0
4	丁亚娜	北京林业大学林木育种国家工程实验室	1	14	1.0	1.0