海南木豆丛枝植原体质粒全序列测定及分析

• 作者: 曹学仁 李玲婷 杨毅 罗大全 车海彦
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 木豆丛枝植原体 质粒 序列分析
• 年，卷（期）: 2014,（7）
• 所属期刊栏目: 作物病虫害及防治、环境保护
• 页码范围: 1404-1408
• 页数: 5页
• 分类号: S432.42
• 字数: 3143字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2014.07.026

摘要

提取木豆叶片基因组总DNA,通过克隆,测序木豆丛枝植原体海南株系质粒(pPPWB-Hn)的完整DNA序列,并使用生物信息学软件对该质粒全长序列进行分析.分析结果显示:pPPWB-Hn质粒全长4 218 bp,含有4个开放阅读框,分别编码Rep、dnaG、threonine synthase和未知蛋白.其中,Rep是2次跨膜蛋白,dnaG是单次跨膜蛋白,Rep和dnaG均与质粒自主复制有关.Rep和未知蛋白可能分布在细胞质中,dnaG可能定位到细胞膜上或膜外,Threonine synthase可能定位到线粒体膜上或线粒体内腔.系统进化树显示:pPPWB-Hn与植原体16SrⅡ组的pPNWB(AY270152),pTBBperi(DQ119297)及pTBBcap(DQ119296)处在同一进化分支.