大豆基因组WRKY31同源基因的生物信息学分析

• 作者: 孙晶 孟宪新 李文滨 王强 盛碧涵 赵雪 韩英鹏 魏淑红
• 来源期刊: 大豆科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 WRKY31 胁迫 WRKY结构域 系统进化
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 642-647
• 分类号: S565.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2014.05.0642

摘要

WRKY转录因子是一类参与多种生物和非生物胁迫的诱导性转录调控因子,在植物进化上高度保守.通过克隆大豆WKY31基因全长和生物信息学分析,发现WRKY31在大豆基因组中存在3个同源基因,分别位于第6、12和13号染色体上;WRKY31蛋白含有1个WRKY结构域(343 ～419 aa)和C2H2型锌指结构,属于第二类WRKY基因.RT-PCR分析表明,Gm WRKY31在大豆的叶、花、豆荚、根、根瘤中的组织内均有表达,且在花中表达量最高,豆荚中最低.通过MEGA 5.0软件分析,大豆和芸豆WRKY蛋白亲缘关系更近,位于同一分支上,而它的2个拷贝Glyma06g46420.2和Glyma12g10350.1位于另一个分支上,亲缘关系较近.蛋白结构及功能预测表明WRKY31是一类转录因子,参与胁迫反应;系统进化分析表明其基因在进化过程中功能上发生了重大分化.