齐口裂腹鱼MyD88基因的cDNA序列及特征分析

• 作者: 叶华 吴青 朱成科 郑宗林 郑曙明
• 来源期刊: 淡水渔业
• 学科: 农学
• 关键词: 齐口裂腹鱼(Schizothorax prenanti) Toll 样受体 髓样分化因子88(MyD88)
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 14-19
• 页数: 6页
• 分类号: S917.4
• 字数: 3254字
• 语种: 中文

摘要

利用RT-PCR和RACE-PCR技术获得了齐口裂腹鱼（ Schizothorax prenanti） TLR信号转导途径中的关键接头分子MyD88基因cDNA全长序列，该序列共1479 bp，包括编码284个氨基酸残基的855 bp的开放阅读框，177 bp 5′非翻译区和447 bp 3′非翻译区，编码284个氨基酸。利用SMART软件分析，结果显示，该蛋白在N端和C端分别存在死亡结构域（Death domain， DD）和TIR结构域（Toll/IL-1 receptor homology domain， TIR）。齐口裂腹鱼MyD88氨基酸序列与鲤（ Cyprinus carpio）、斑马鱼（ Danio rerio）、大黄鱼（ Larimichthys crocea）、花鲈（ Lateolabrax japonicas）、虹鳟（ Oncorhynchus mykiss）的相似性为69.37％～91.90％，其中与斑马鱼的相似性最高。用 NJ 法构建的系统进化树中，齐口裂腹鱼MyD88和其它鱼类MyD88聚为一枝。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱成科	西南大学鱼类繁育与健康养殖研究中心	53	138	8.0	10.0
2	郑曙明	西南大学鱼类繁育与健康养殖研究中心	74	581	13.0	22.0
3	吴青	西南大学鱼类繁育与健康养殖研究中心	67	466	13.0	21.0
4	郑宗林	西南大学鱼类繁育与健康养殖研究中心	68	374	10.0	17.0
5	叶华	西南大学鱼类繁育与健康养殖研究中心	13	117	6.0	10.0