低温胁迫下冬小麦东农冬麦1号分蘖节相关EST-SSR信息分析

• 作者: 于晶 孟婧 宋扬 张达 牟永潮 王军虹 苍晶 范博 许贺
• 来源期刊: 东北农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 冬小麦 东农冬麦1号 低温胁迫 分蘖节 EST SSR
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1-5
• 页数: 5页
• 分类号: S512.1+1
• 字数: 2866字
• 语种: 中文

摘要

利用抑制消减杂交技术构建东农冬麦1号分蘖节低温胁迫相关基因的cDNA正反文库,获得表达序列标签EST (Expressed sequence tag),经分析和前期处理后拼接得到736条非重复序列(Unigenes).运用生物信息学方法对低温胁迫下诱导的冬小麦东农冬麦1号分蘖节相关EST-SSRs分布频率和碱基重复特点进行归纳分析.结果表明,736条Unigenes共检索到59个EST-SSRs,EST-SSRs出现频率为8.02％.EST-SSRs包括24种重复单元,其主要以三核苷酸和二核苷酸重复基元为主,二者分别占总SSRs 47.46％和44.07％,在EST中出现频率分别为3.80％和3.53％,其中以二核苷酸CA和AG重复基元为主,三核苷酸重复基元以AAC重复基元所占比例最高.为冬小麦EST资源开发和抗寒基因挖掘奠定基础.