运用四种线性模型对京海黄鸡上市体重进行全基因组关联分析

• 作者: 唐莹 张涛 张跟喜 施会强 樊庆灿 王金玉 顾玉萍
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 京海黄鸡 上市体重 GWAS GLM MLM
• 年，卷（期）: 2014,（7）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 1053-1059
• 页数: 7页
• 分类号: S831.2
• 字数: 4117字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2014.07.004

摘要

旨在使用4种模型对京海黄鸡的16周龄体重进行全基因组关联分析(GWAS).试验以京海黄鸡母鸡为试验材料,通过60KSNP芯片分型,并使用2种线性回归模型和广义线性模型(GLM)、混合线性模型(MLM)4种模型对基因型数据和京海黄鸡16周龄体重进行关联分析.结果表明,虽然4种模型识别出的显著SNPs(P＜0.05)数目不同,但各有优缺点.此外,本研究共识别20个与京海黄鸡上市体重关联显著的SNPs(P＜0.05).这些SNPs主要分布于1、4、19、25和Z染色体上,其中,1号染色体50.6～53.6 Mb和Z染色体33.6～44.8 Mb区域是显著SNPs(P＜0.05)分布较为集中的区域.另外还有部分显著SNPs(P＜0.05)位于之前报道的影响鸡生长性状的QTL内.最后,本研究还找到了17个候选基因,同时还探讨了FAM184B、NCAPG和NLK的功能,所有的这些结果将促进鸡生长性状标记的研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王金玉	扬州大学动物科技学院	172	1985	24.0	37.0
2	顾玉萍		20	80	6.0	7.0
3	张跟喜	扬州大学动物科技学院	55	269	9.0	14.0
4	樊庆灿	扬州大学动物科技学院	3	25	3.0	3.0
5	唐莹	扬州大学动物科技学院	4	28	3.0	4.0
6	施会强		23	80	5.0	8.0
7	张涛	扬州大学动物科技学院	22	75	4.0	8.0