猪繁殖与呼吸综合征病毒Shanxi-6株全基因序列分析

• 作者: 刘文俊 吴忻 姚敬明 孟帆 杨丽华 樊振华 武守艳 王娟萍 郭慧慧 陈剑波 雷宇平 韩一超
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒 基因组 序列分析
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 页码范围: 62-65
• 页数: 4页
• 分类号: Q78
• 字数: 2934字
• 语种: 中文

摘要

采用RT-PCR方法,分段扩增出猪繁殖与呼吸综合征病毒( PRRSV) Shanxi-6株15个基因片段,并将这15个片段分别连接到pMD18-T载体上进行克隆测序、拼接后,得到PRRSV Shanxi-6株全基因组长15320 bp (不包含PolyA尾),包含9个开放阅读框,5′UTR长189 bp,3′UTR长150 bp。基因组序列分析结果表明,Shanxi-6株与欧洲型代表毒株LV的核苷酸序列同源性为54.35%,与美洲型代表毒株VR-2332的核苷酸序列同源性为88.80%,与HP-PRRSV毒株(JXA1、HUN4、HuN、HUB1)亲缘关系最近,核苷酸序列同源性高达97.44%~97.74%,且在非结构蛋白Nsp2上有30个氨基酸的缺失。