陆地棉SSR标记遗传多样性及其与农艺性状的关联分析

• 作者: 李运海 桑晓慧 王红梅 赵云雷 郭志军 陈伟 龚海燕
• 来源期刊: 棉花学报
• 学科: 农学
• 关键词: 陆地棉 关联分析 SSR 遗传多样性 群体结构
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 所属期刊栏目: 研究与进展
• 页码范围: 420-430
• 页数: 11页
• 分类号: S562.035
• 字数: 7652字
• 语种: 中文

摘要

分析陆地棉栽培种遗传多样性,通过关联分析寻找与棉花农艺性状相关联的分子标记,为分子标记辅助选择育种和提高棉花育种效率奠定基础.本文采用74个Simple sequence repeat(SSR)标记对172份陆地棉栽培种的基因组变异进行扫描,使用NTSYS-pc 2.20进行聚类,分析该群体遗传多样性;利用Structure 2.3.4软件分析群体结构,在此基础上结合田间表型数据,采用Tassel 2.1的一般线性模型(General linear model,GLM)进行关联分析,定位与农艺性状相关的QTLs.74个标记共检测到148个多态性位点,涉及246个等位变异,变异范围2～7个,平均等位变异数为3.32;引物的多态性信息含量(PIC)为0.0281～0.3733,平均值为0.2370;遗传相似系数变异在0.2816～1,平均值为0 5369,平均遗传相似系数为0 5369,表明我国陆地棉遗传基础狭窄,尽管国外及西北内陆棉区部分材料具有较丰富的遗传变异.聚类分析将该群体划分为12个亚群,不同棉区的材料交叉分布,且聚类结果基本与系谱吻合.群体结构分析却将172份供试材料划分为3个亚群;通过关联分析,发现30个位点与铃重、衣分、黄萎病抗性显著相关(P＜0 05),各位点对表型变异贡献率为2.24％～5.27％.