雷蒙德氏棉Argonaut基因家族的生物信息学预测与分析

• 作者: 于霁雯 刘国元 吴嫚 喻树迅 裴文锋
• 来源期刊: 棉花学报
• 学科: 农学
• 关键词: 雷蒙德氏棉 AGO基因家族 基因结构 表达模式
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 所属期刊栏目: 研究与进展
• 页码范围: 411-419
• 页数: 9页
• 分类号: S562.035.3
• 字数: 5460字
• 语种: 中文

摘要

Argonaute(AGO)蛋白是参与小RNA调控通路的重要元件,在生命体的生长发育过程中发挥着重要作用.本研究利用AGO蛋白的保守域在雷蒙德氏棉基因组中进行同源比对,鉴定出15个成员,并对其进行进化关系、染色体定位、基因结构、保守域、时空表达模式等分析.结果表明:该家族成员基因长度从3335到9086bp不等,其中11个基因被定位到7条染色体上;该家族成员可分为3个亚族,包含5个小组,各亚族内、小组间成员也存在很高的保守性;发现每个基因都有不同的时空表达模式,且各小组内成员之间存在协同和互补2种表达模式,找到在花器官特异表达的基因1个,胚珠中特异表达的基因3个.本文首次对棉花中AGO基因家族进行了鉴定和生物信息学分析,为进一步研究AGO基因家族在棉花中的功能奠定了基础.