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传染性支气管炎病毒广西分离株S1基因克隆与序列分析
传染性支气管炎病毒广西分离株S1基因克隆与序列分析
作者:
孙宝丽
李广伟
薛瑜
谢青梅
陈丽
陈峰
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
传染性支气管炎病毒
S1 基因
序列分析
摘要:
近年来,鸡传染性支气管炎(IB)在我国广西地区相继暴发,流行十分广泛,给养禽业带来巨大损失。为及时了解传染性支气管炎病毒(IBV)的变异情况,从而进行更有效的防控,本研究对2012年分离自广西的8株IBV的S1基因进行了序列测定与分析。参考NCBI上的IBV S1基因序列,设计合成了一对扩增S1基因全长序列的引物。采用 RT-PCR方法对8株 IBV分离株(GX1-GX8)的 S1基因进行克隆测序。序列分析结果表明,8株IBV分离株S1基因全长均为1620 bp,且集中分布在2个分支,GX1-GX4属于第Ⅴ分支,其裂解位点均为RRFRR;GX5-GX8属于第Ⅰ分支,其裂解位点均为 HRRRR,为 IBV中国毒株所特有。同时,这些分离株进化趋势与其分离时间之间显示出一定的相关性;潜在糖基化位点(PGS)分析结果显示,GX1-GX4的PGS分布一致且与GX5-GX8的分布显示出一定的差异;核苷酸同源性分析结果表明,位于同一分支的毒株间同源性较高,所有分离毒株与我国使用的常规 Mass 型疫苗毒株的同源性均偏低。这暗示目前广西IBV分离毒株与我国广泛使用的IB疫苗毒株的遗传进化距离较远,常规Mass型疫苗可能起不到很好的免疫保护作用。
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IBV分离株
克隆
序列分析
膜蛋白基因
7株鸡传染性支气管炎变异流行病毒的分离鉴定
鸡传染性支气管炎病毒
分离鉴定
S1基因
序列分析
内容分析
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文献信息
篇名
传染性支气管炎病毒广西分离株S1基因克隆与序列分析
来源期刊
动物医学进展
学科
农学
关键词
传染性支气管炎病毒
S1 基因
序列分析
年,卷(期)
2014,(3)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
68-72
页数
5页
分类号
S852.659.6
字数
3280字
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
陈峰
华南农业大学动物科学学院
45
233
9.0
13.0
2
陈丽
华南农业大学动物科学学院
10
75
5.0
8.0
4
谢青梅
华南农业大学动物科学学院
112
510
12.0
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5
李广伟
华南农业大学动物科学学院
3
20
3.0
3.0
8
孙宝丽
华南农业大学动物科学学院
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薛瑜
华南农业大学动物科学学院
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2020(2)
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传染性支气管炎病毒
S1 基因
序列分析
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研究来源
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研究去脉
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相关学者/机构
期刊影响力
动物医学进展
主办单位:
西北农林科技大学
出版周期:
月刊
ISSN:
1007-5038
CN:
61-1306/S
开本:
大16开
出版地:
陕西杨陵西北农林科技大学动物医学院
邮发代号:
52-60
创刊时间:
1980
语种:
chi
出版文献量(篇)
7631
总下载数(次)
22
总被引数(次)
56446
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