棉花盐胁迫下叶片miRNAs的鉴定与分析

• 作者: 何守朴 庞保印 彭振 杜雄明 许菲菲 龚文芳
• 来源期刊: 棉花学报
• 学科: 农学
• 关键词: 盐胁迫 miRNA 小RNA测序 靶基因预测
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 所属期刊栏目: 研究与进展
• 页码范围: 377-386
• 页数: 10页
• 分类号: S562.035
• 字数: 5361字
• 语种: 中文

摘要

microRNAs (miRNAs)是一类21～24个核酸长度的非编码小分子RNA(sRNA,small RNA),通过介导目标mRNA的切割或者抑制翻译来调节植物基因的表达.本文利用200 mmol· L-1NaCl分别处理3叶期耐盐品系早熟长绒7号和盐敏感品系南丹巴地大花4h,构建了4个小RNA文库并测序.以雷蒙德氏棉(Gossypium raimondii L.)D5基因组和本实验室陆地棉(Gossypium hirsutum L.)盐胁迫转录组测序拼接得到的序列作为参考,共发现360个miRNA,包括308个保守的miRNA和52个可信度高的新miRNA.2个品系共出现94个差异表达的miRNA,表达模式可分为2大类,筛选出20个候选miRNA.KEGG (Kyoto encyclopedia of genes and genomes)分析表明,耐盐品系显著富集的信号通路是抗原加工过程,而盐敏感品系显著富集的是生物碱合成途径.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杜雄明	中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室	57	1053	18.0	31.0