hsa-miR-1908上游启动子区的生物信息学分析

• 作者: 倪毓辉 匡仟卉柠 季晨博 徐美玉 李景云 郭锡镕
• 来源期刊: 临床儿科杂志
• 关键词: miR-1908启动子区 生物信息学分析 转录因子结合部位
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 379-383
• 页数: 5页
• 字数: 2873字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-3606.2014.04.023

摘要

目的：利用各种生物信息学工具预测hsa-miR-1908上游启动子功能，以进一步研究其在人脂肪细胞中的转录调控机制。方法应用Ensemble数据库获取hsa-miR-1908上游启动子序列，利用多种在线相关软件预测出甲基化部位和转录因子结合部位。结果获取hsa-miR-1908上游启动子序列全长1458 bp。miR-1908启动子序列中CpG岛位于（438～756）bp、（836～937）bp、（979～1374）bp处，CpG岛的存在会抑制miR-1908启动子的转录。miR-1908有15个转录因子的结合位点。结论 miRNA启动子相关生物信息学的研究，提高对启动子的研究效率，为进一步研究miR-1908的转录调控机制提供了重要的信息。