基于转录组数据高通量发掘扶桑绵粉蚧微卫星引物

• 作者: 宾淑英 张鹤 林进添 罗梅
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 扶桑绵粉蚧 转录组 简单重复序列 微卫星DNA 引物
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 生理与生化
• 页码范围: 395-400
• 分类号: Q966
• 语种: 中文

摘要

[目的]扶桑绵粉蚧Phenacoccus solenopsis Tinsley是我国重要的检疫性害虫.简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)研究在遗传图谱和物理图谱的构建、分子标记辅助育种、品种鉴定、基因定位、遗传多样性、动植物分类和进化等方面具有重要意义.筛选的SSR引物将为扶桑绵粉蚧遗传多样性分析、进化分析及入侵生物学等奠定基础.[方法]利用高通量搜索的方法对扶桑绵粉蚧转录组中28 120条unigenes的数据进行搜索.[结果]共找到1 781个SSR位点.扶桑绵粉蚧转录组中SSRs的主要重复类型是单核苷酸重复,占SSR总数的89.44％;其次是三核苷酸重复,占SSR总数的7.52％.单核苷酸重复里主要是A/T基序,占了总量的87.42％.基于筛选的SSRs,运用Primer 3软件进行引物的批量设计,共有481个unigenes成功设计引物,共设计出1 228对引物.[结论]研究表明利用扶桑绵粉蚧转录组数据开发SSR标记是可行的,本研究开发的引物将为扶桑绵粉蚧遗传多样性分析、进化分析及入侵生物学等奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林进添	仲恺农业工程学院外来有害生物预警与控制研究所	61	868	15.0	27.0
2	宾淑英	仲恺农业工程学院外来有害生物预警与控制研究所	48	572	13.0	22.0
3	罗梅	仲恺农业工程学院外来有害生物预警与控制研究所	32	136	7.0	11.0
4	张鹤	仲恺农业工程学院外来有害生物预警与控制研究所	4	43	2.0	4.0