蒙古沙冬青保守microRNAs的鉴定及靶基因预测

• 作者: 周宜君 孙鹏 张孜宸 李华云 李章磊 王宁 陈静 高飞
• 来源期刊: 遗传
• 关键词: 蒙古沙冬青 microRNAs 高通量测序 靶基因预测
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 页码范围: 485-494
• 页数: 10页
• 字数: 5615字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1005.2014.0485

摘要

蒙古沙冬青(Ammopiptanthus mongolicus)是生长在荒漠中的木本植物,对于我国西北部干旱、半干旱区域的植被维护与恢复具有重要价值。蒙古沙冬青对干旱、低温等多种逆境具有较高的耐受性,是研究林木耐受逆境生理与分子机制的合适材料。MicroRNA(miRNA)是一类长度约为21个核苷酸的内源性非编码小分子RNA,在植物生长发育和逆境应答等生物学过程中发挥着重要的调控作用。目前,许多植物物种的miRNAs已经获得鉴定,但未见蒙古沙冬青miRNAs的相关报道。文章应用高通量测序和生物信息学分析方法对蒙古沙冬青幼苗保守miRNAs的类型、表达丰度以及靶基因进行了分析和预测。共鉴定了10个家族的19种保守miRNAs,其表达丰度介于55~1920269个拷贝之间。通过在线软件psRNATarget预测了其中14个保守miRNAs的靶基因。对于这些靶基因的功能分析表明,蒙古沙冬青的保守 miRNA 主要通过转录调控、激素信号途径、物质代谢和胁迫应答等生物学过程参与植物生长发育和环境响应。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高飞	中央民族大学生命与环境科学学院	42	203	8.0	12.0
2	陈静	中央民族大学生命与环境科学学院	9	24	2.0	4.0
3	张孜宸	中央民族大学生命与环境科学学院	5	29	3.0	5.0
4	孙鹏	中央民族大学生命与环境科学学院	2	2	1.0	1.0
5	李章磊	中央民族大学生命与环境科学学院	6	28	2.0	5.0
6	李华云	中央民族大学生命与环境科学学院	5	19	3.0	4.0
7	王宁	中央民族大学生命与环境科学学院	9	22	3.0	4.0