8种柱花草属牧草SSR-PCR反应体系优化及引物筛选

• 作者: 丁西朋 严琳玲 张龙 白昌军 胡珊娜
• 来源期刊: 草业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 柱花草 改进CTAB法 SSR-PCR 体系优化 引物筛选
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 植物生产层
• 页码范围: 232-242
• 页数: 11页
• 分类号: S816|S54
• 字数: 4935字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11829\j.issn.1001-0629.2013-0550

摘要

柱花草(Stylosanthes)是优良的豆科牧草,叶片中含有大量的多糖多酚,本研究利用改良CTAB法抽提柱花草叶片中总DNA.通过正交试验设计L16 (45),确立了柱花草SSR-PCR最佳反应体系:20 μL体系中1 μL 50ng·μL 1模板DNA,1.6 μL 5 μmol·L-1引物,1.6μL10mol·L-1 dNTPs,1.2μL25mol·L-1 Mg2+,0.3μL 5U·μL-1 Taq聚合酶,2μL 10×PCR Buffer(Mg2+ free),剩余用ddH2O补足.扩增反应程序为94℃变性40 s,Tm(不同退火温度)退火时间40 s,72℃延伸45 s,循环数35个.利用优化体系对来自7种柱花草的123对SSR引物在8个不同种柱花草中进行转移,共筛选出44对引物在8种柱花草中都能有效扩增,并从中筛选出26对在8个不同种柱花草中富含多态性引物,为今后利用SSR标记对柱花草属的指纹图谱构建、遗传多样性分析、分子育种和品种鉴定与保护等工作提供重要依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	白昌军	中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所	155	1252	18.0	25.0
2	张龙	海南大学农学院	12	28	2.0	5.0
4	严琳玲	中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所	24	111	6.0	9.0
5	丁西朋	中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所	16	73	6.0	8.0
8	胡珊娜	海南大学农学院	2	21	1.0	2.0