大豆NAC基因家族生物信息学分析

• 作者: 柏锡 王洋
• 来源期刊: 大豆科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 生物信息学 NAC基因家族
• 年，卷（期）: 2014,（3）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 325-333
• 分类号: S565.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2014.03.0325

摘要

NAC转录因子是植物特有的具有多种生物功能的一类重要转录因子,广泛参与植物生长发育以及生物与非生物逆境应答等.本文利用生物信息学手段,结合大豆基因组数据库及NCBI数据库,识别、筛选并获得了大豆NAC家族基因的蛋白序列,并对其进化关系、在基因组上的定位分布以及理化特性进行了预测和分析.结果显示具有NAC结构域的152条大豆氨基酸序列认为是假定NAC蛋白质,共分为10个亚家族,连锁群定位结果发现大豆的20条染色体上均有NAC转录因子的分布,其中第12号染色体上分布最多.不同亚族间的大豆假定NAC蛋白质理化特性存在一定的差异,无规则卷曲和α-螺旋是蛋白质二级结构最大量的结构元件,并散布于整个蛋白.本研究结果将为大豆NAC基因家族的进一步功能分析奠定重要的研究基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	柏锡	东北农业大学生命科学学院	80	891	15.0	26.0
2	王洋	东北农业大学生命科学学院	50	232	9.0	13.0