中华稻蝗金属应答转录因子基因OcMTF-1的分子特性及表达分析

• 作者: 任丽娴 余志涛 刘晓健 张建珍 郭亚平 马恩波
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 中华稻蝗 金属应答转录因子-1 基因克隆 RT-qPCR 表达模式
• 年，卷（期）: 2014,（9）
• 所属期刊栏目: 生理与生化
• 页码范围: 1001-1007
• 分类号: Q966
• 语种: 中文

摘要

[目的]金属应答转录因子-1(metal-responsive transcription factor-1,MTF-1)是一种多功能转录调控蛋白,可在机体应对重金属、低氧或氧化压力环境时发挥作用.本研究旨在确定中华稻蝗Oxya chinensis MTF-1基因在不同组织部位及不同发育时期的表达模式.[方法]基于中华稻蝗转录组数据库,搜索到MTF-1 cDNA片段,采用RACE方法克隆获得MTF-1的5'端和3'端序列.利用不同生物信息学软件对所得序列进行结构域预测、氨基酸序列比对和进化树分析.根据该基因的核苷酸序列,设计特异性表达引物,利用RT-qPCR方法研究其在中华稻蝗不同组织部位及不同发育时期的表达.[结果]克隆获得中华稻蝗MTF-1 cDNA全长序列,命名为OcMTF-1(GenBank登录号:KM017748),其长为1 834 bp,其中开放式阅读框(ORF)为1 527 bp,编码508个氨基酸.结构域预测发现,该序列只含有6个C2H2型锌指结构,无其他激活域.氨基酸序列比对发现,OcMTF-1 N端的锌指结构域与目前已知的其他昆虫的MTF-1有很高的相似度.OcMTF-1在中华稻蝗马氏管中高表达,其次是后肠和脂肪体,其他组织部位表达量相对较低;在1-5龄若虫期和成虫期均表达.[结论]本研究克隆获得中华稻蝗OcMTF-1基因cDNA全长序列,其编码蛋白N端的锌指结构域与其他昆虫MTF-1序列一致性较高.该基因在中华稻蝗马氏管中高表达;在若虫和成虫各发育阶段均有表达,其中1龄若虫期表达量最高.研究结果为进一步探索OcMTF-1基因的转录调控机制提供了基础资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭亚平	山西大学生命科学学院	99	1394	18.0	30.0
2	马恩波	山西大学应用生物学研究所	170	2032	22.0	34.0
3	张建珍	山西大学应用生物学研究所	75	561	13.0	19.0
4	刘晓健	山西大学应用生物学研究所	14	108	7.0	10.0
5	余志涛	山西大学应用生物学研究所	2	14	2.0	2.0
6	任丽娴	山西大学应用生物学研究所	1	2	1.0	1.0