烟草黄瓜花叶病毒湖北分离物全基因组序列分析及亚组鉴定

• 作者: 侯明生 李锋 杨军 武明珠 王燃 罗朝鹏 金大伟 魏攀 魏春阳
• 来源期刊: 烟草科技
• 学科: 农学
• 关键词: 黄瓜花叶病毒 基因组 同源性 系统进化树
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 病虫害防治
• 页码范围: 80-84
• 页数: 5页
• 分类号: S432.41
• 字数: 2749字
• 语种: 中文

摘要

为明确我国湖北烟区烟草黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)的亚组类型,对湖北地区侵染烟草的CMV HB24株系进行基因组全长克隆和序列分析 结果表明,HB24株系RNA1(GenBank序列号:KC019299)全长为3363个核苷酸(nt),编码993个氨基酸的1a蛋白;RNA2(GenBank序列号:KC019300)全长为3049nt,编码859个氨基酸的2a蛋白和111个氨基酸的2b蛋白;RNA3(GenBank序列号:KC019301)全长为2216nt,编码279个氨基酸的3a蛋白和218个氨基酸的CP蛋白 核苷酸序列同源性分析表明,HB24与Fnv,SD和Q株系RNA1同源性分别为91.6％,91.1％和75.9％,RNA2同源性分别为91.8％,97.8％和69.5％,RNA3同源性分别为92.1％,93.4％和73.2％;与同属花生矮化病毒(Peanut stunt virus,PSV)ER株系RNA1,RNA2和RNA3的同源性分别为65.5％,56.7％和54.1％,与同属番茄不孕病毒(Tomato aspermy virus,TAV)V株系同源性分别为66.9％,57.7％和51.5％ HB24 RNA3 5'NTR(Nontranslated region)的结构分析以及RNA35'NTR和CP基因核苷酸序列系统进化树的分析表明,HB24属于CMV亚组IB.