霍乱弧菌基因表达分析中内参基因的选择

• 作者: 张翠彩 蒋秀高 逄波 阚飙
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 霍乱弧菌 qRT-PCR 内参基因 geNorm
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 433-438
• 页数: 6页
• 分类号: R378
• 字数: 4915字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/cjz.j.issn.1002-2694.2014.05.001

摘要

目的 确定不同实验条件下基因表达分析中的稳定内参基因.方法 以霍乱弧菌O1群El Tor菌株为研究对象,利用qRT-PCR方法比较不同pH值(pH 8.0、pH 5.5)以及不同温度(37℃、30℃)等多种生理、外界环境模拟培养条件下,thyA、recA、rpoA、gyrB、16SrRNA以及VCA0862 6个候选内参基因的表达水平,利用geNorm软件评价其稳定性.结果 不同培养条件下,6个候选内参基因表达水平存在差异.不同pH值条件下最佳基因是recA;不同温度条件下最佳基因是gyrB;不同pH值及温度综合评价时,最佳基因是recA.结论 本研究评价和提出了细菌基因表达分析中内参基因筛选的重要性,不同实验条件下最稳定内参基因是不同的,针对不同条件下的基因转录定量分析,应分别对内参基因稳定性进行评价并选择最稳定基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	阚飙	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	120	614	11.0	19.0
2	逄波	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	18	109	4.0	10.0
3	蒋秀高	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	23	114	5.0	9.0
4	张翠彩	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所	11	36	4.0	5.0