人类CD4＋T细胞核小体定位模式及其与TFBS分布特征关系研究

• 作者: 崔颖 蓝贤梅 黄艳
• 来源期刊: 哈尔滨医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 核小体定位 CD4+T细胞 转录因子结合位点 定位模式
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 36-39
• 页数: 4页
• 分类号: R39
• 字数: 2893字
• 语种: 中文

摘要

目的：研究人类CD4＋T细胞全基因组核小体抑制和激活状态下的定位模式，转录因子结合位点（ Transcription factor binding site ， TFBS）分布特征以及两者之间的关系。方法采用生物信息学软件R、Java等通过编写比对算法进行统计学分析。结果人类CD4＋T细胞中核小体定位在染色质上的分布比例为0.6，从休眠到激活状态核小体定位发生位置改变，呈现稳定定位模式和动态定位模式，且比例分别为2％和98％，核小体定位具有较大的动态变化性；核小体定位与TFBS位置关系研究中，发现分布在核小体内的TFBS数目较大，但总体长度较短；而分布在连接DNA上的TFBS数目相对较少，但总体长度较长。结论人类CD4＋T细胞休眠和激活状态下全基因组的核小体定位模式基本一致，核小体定位与TFBS关系有明显特征。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	崔颖	哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院系统生物学教研室	21	47	4.0	4.0
2	黄艳	哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院系统生物学教研室	3	7	1.0	2.0
3	蓝贤梅	哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院系统生物学教研室	1	1	1.0	1.0