拟南芥高丝氨酸激酶HSK的分子结构与同源建模研究

• 作者: 常洪平 张骋 曾荣 王萍 肖文君 胡帅 袁聪颖 郭新红 陆秀涛
• 来源期刊: 激光生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 拟南芥 高丝氨酸激酶 分子结构 同源建模
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 147-154
• 页数: 8页
• 分类号: Q786
• 字数: 5562字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-7146.2014.02.009

摘要

高丝氨酸激酶(EC 2.7.1.39)是拟南芥中合成甲硫氨酸和苏氨酸的关键酶之一.作者利用DNAMAN软件分析高丝氨酸激酶的氨基酸组成和等电点;利用生物信息学在线网站预测分析其疏水性、二级结构、跨膜结构域、信号肽区域、PEST序列、化学修饰位点及亚细胞定位等;利用SWISS-MODEL软件进行同源建模,使用Chimera(V1.8.1)做结构修饰处理,最后利用Molprobity4及ERRAT(V2.0)对建模结果进行结构质量分析.结果发现:HSK预测等电点为8.48,平均亲水性0.267;二级结构中α-螺旋占34.32％,不规则卷曲占48.11％,延伸链占17.57％;高丝氨酸激酶的预测模型经验证具有稳定的空间结构,符合立体化学规则.