三明野生蕉Whirly转录因子的克隆及其在低温胁迫下的定量表达分析

• 作者: 杨洋 赖恭梯 赖钟雄
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 三明野生蕉 Whirly 基因克隆 生物信息学 荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2014,（8）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 1533-1538
• 页数: 6页
• 分类号: Q943.2
• 字数: 3776字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2014.08.015

摘要

以三明野生蕉叶片为材料,通过克隆获得Whirly基因的ORF,并研究Whirly基因在不同温度处理下的转录水平.结果表明:采用PT-PCR结合RACE技术,克隆得到三明野生蕉Whmy基因,其在GenBank的登录号为KC127691.Whirly的开放阅读框为738 bp,编码245个氨基酸.生物信息学分析显示,Whirly蛋白属于亲水蛋白,不具有信号肽,二级结构由α螺旋、β折叠和无规则卷曲组成,保守结构域预测显示该基因属于植物Whmy转录因子基因家族.实时荧光定量PCR分析显示,Whirly转录因子在不同低温胁迫下表达水平有较大差异,随着温度的降低,相对表达量呈“M”型变化模式,在20℃和4℃时达到较高的转录水平,结合前人研究结果可知,三明野生蕉Whirly转录因子可能参与了包括抗寒等多个抗逆途径的调控.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖钟雄	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	473	4127	31.0	41.0
2	赖恭梯	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	14	106	7.0	10.0
3	杨洋	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	2	4	2.0	2.0