水稻S5-ORF3蛋白质的进化分析

• 作者: 张屹 张达瀚
• 来源期刊: 河北科技大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 水稻 S5-ORF3蛋白 进化树 正向选择 配体结合
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 建筑科学、环境科学与生命科学
• 页码范围: 397-402
• 页数: 6页
• 分类号: Q816
• 字数: 2746字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7535/hbkd.2014yx04015

摘要

生殖隔离在形成新物种和物种同一性的保持中有重要作用,因而在水稻优化育种中有重要的意义.S5位点是一个已克隆的控制水稻生殖隔离的基因,它产生的S5-ORF3,ORF4和ORF5蛋白质共同调控着indica-japonica杂交后代的育性,特别是S5-ORF3蛋白质在打破水稻亚种indica-japonica之间的生殖隔离与促进物种间的基因交流中发挥重要作用.针对S5-ORF3的进化分析对于研究它的功能和起源很重要,但目前尚无报道.本文基于序列和进化分析,提出S5ORF3为一种定位在内质网中的新的HSP70家族蛋白,但缺乏HSP70的C端的多肽结合结构域,推测S5-ORF3可能通过影响alpha淀粉酶的合成来作用于内质网压力;找到了ORF3的19条同源蛋白,并用极大似然算法构建了可靠的进化树,发现水稻的S5-ORF3与节节麦的luminal-binding蛋白进化关系最为密切;作了置信度100％的S5-ORF3蛋白质的三维结构预测,预测了居中的配体绑定位点;发现了水稻的S5-ORF3与其他HSP70蛋白相比独特的基序,为进一步研究S5-ORF3的作用机理和演化历史提供了线索和数据支持.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张达瀚	华中农业大学生命科学技术学院	1	3	1.0	1.0
2	张屹	河北科技大学理学院	7	13	2.0	3.0