兰州鲇线粒体Cytb基因的克隆与序列分析

• 作者: 侯玉霞 吴旭东 肖伟 连总强
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 兰州鲇 线粒体Cytb 序列分析
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 页码范围: 772-779
• 页数: 8页
• 分类号: S917
• 字数: 4920字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7541/2014.108

摘要

为克隆兰州鲇(Silurus lanzhouensis)线粒体Cytb基因全序列,根据欧洲鲇(Silurus glanis)线粒体基因全序列设计特异引物进行兰州鲇线粒体Cytb基因的PCR扩增,得到1138 bp兰州鲇线粒体Cytb基因序列。对兰州鲇和其他13种鱼的线粒体Cytb基因核苷酸和氨基酸序列之间进行同源性比较,结果显示具有较高的同源性,核苷酸同源性介于61.38%-91.12%,氨基酸同源性介于76.62%-95.52%。对兰州鲇、欧洲鲇、大口鲇(Silurus meridionalis)、鲇(Silurus asotus)、越南鲇(Silurus cochinchinensis)的Cytb基因之间进行碱基替代分析,结果显示兰州鲇Cytb基因与鲇之间替换率最低,值为8.87%,转换/颠换值为3.21；与越南鲇之间替换率最高,值为14.41%,转换/颠换值为1.83。对本文克隆的兰州鲇Cytb基因与王庆容等测定的兰州鲇线粒体Cytb 序列进行序列差异分析,结果显示两者之间替换率为11.16%,存在127个变异位点,转换/颠换比为4.08,遗传距离为0.1230。由NJ法基于兰州鲇和其他13种鱼的Cytb基因序列构建的系统进化树,结果显示与传统的分类地位基本吻合。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	连总强	甘肃农业大学动物科学技术学院	10	52	5.0	7.0
3	侯玉霞	中国农业大学理学院	26	353	10.0	18.0
4	吴旭东	甘肃农业大学动物科学技术学院	17	140	6.0	11.0
10	肖伟		5	38	2.0	5.0