苹果全基因组SBP-box基因家族分析及代表成员的分子克隆

• 作者: 刘冠群 孙玉燕 宋江萍 常兆晶 张晓辉 李锡香 王冠 邱杨 魏小春
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 苹果 SBP-box家族 分子进化 基因克隆
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 果树
• 页码范围: 215-226
• 分类号: S661.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0513-353X.2014.02.002

摘要

从金冠苹果基因组中鉴定出33个SBP-box家族基因,其中20个为miR156的靶基因.通过进化分析,对该家族成员进行了系统分类和功能预测.大部分预测的基因在富士苹果基因组中存在并表达,并且发现可变剪切在该家族基因中高频出现.在富士苹果中克隆了4个代表性成员基因,即MdSPL2、MdSPL 11、MdSPL13和MdSPL33;与金冠相比,MdSPL33是一个缺失第2和3外显子的剪切本,并具有2个单碱基变异;MdSPL11和MdSPL13分别存在4个和2个单碱基变异,造成3个和1个氨基酸改变.