鳙Sox基因克隆及序列进化分析

• 作者: 俞小牧 童金苟 郭稳杰
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 鳙 Sox基因 基因组加倍 系统进化树 分化时间
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 页码范围: 664-668
• 页数: 5页
• 分类号: Q781
• 字数: 3720字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7541/2014.94

摘要

利用简并引物SoxN和Sox9在鳙基因组DNA中进行PCR扩增和产物克隆测序，并对序列进行同源性比较和系统进化分析。结果表明本文鉴定出鳙15个Sox基因HMG盒序列，分别属于 SoxB、SoxC和 SoxE组，依据斑马鱼同源基因将其分别命名为Sox1a、Sox1b、Sox2、Sox3、Sox4a、Sox4b、Sox9a、Sox9b、Sox10、Sox11b、Sox12、Sox14a、Sox14b、Sox19和Sox21a。基于鳙和斑马鱼 Sox1、Sox4和Sox9基因核苷酸序列构建的系统进化树显示这3个Sox基因的复制时间发生在鳙和斑马鱼的分化之前，结果支持了鱼类特异的基因组复制假说。以Sox1a、Sox1b和Sox4基因为分子钟标记构建系统进化树探讨鳙和斑马鱼的分化时间，结果显示，同属于鲤科鱼类的鳙(鲤亚科)和斑马鱼(鱼丹亚科)在原始的鱼丹亚科鱼类中存在一个共同祖先，大约出现在63.7百万年前。研究结果为进一步研究鱼类Sox基因复制和基因组进化等问题提供了重要参考资料。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	俞小牧	中国科学院水生生物研究所	17	366	9.0	17.0
2	童金苟	中国科学院水生生物研究所	22	625	11.0	22.0
3	郭稳杰	中国科学院水生生物研究所	1	11	1.0	1.0