哈维氏弧菌适配子的SELEX筛选及其亲和特异性研究

• 作者: 刘瑞 宋林生 郑江 郝聚敏
• 来源期刊: 生物化学与生物物理进展
• 关键词: 哈维氏弧菌 适配子 亲和力 亲和常数 SELEX
• 年，卷（期）: 2014,（7）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 704-711
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1206.2013.00413

摘要

哈维氏弧菌是水产养殖中的重要条件致病菌,对其进行快速、准确地检测和鉴定是相关病害防治的基础和关键.适配子具有亲和力高、特异性强、稳定性好等优点,在微生物的检测和鉴定方面呈现出广泛的应用前景.本研究以哈维氏弧菌为靶目标,采用SELEX技术,即指数级富集配体的系统进化技术,筛选其特异性适配子.经15轮筛选后,随机ssDNA文库的亲和力从3.51上升到58.95,提高了15.8倍.筛选出的适配子富集库经克隆、测序后得到52条不同序列,根据同源性将这些序列分成8个家族,其中第1和第2家族的适配子数量最多,超过总数的50％.通过深入分析,筛选出6个对哈维氏弧菌有显著亲和特异性(P＜0.01)的高频适配子,其中5个高频适配子(S1、S25、S26、S27、S35)对哈维氏弧菌有较高的亲和力,相应的亲和常数Kd值分别为(32.6±7.1)、(45.3±10.1)、(24.7±5.8)、(34.8±5.6)、(12.9±4.0) nmol/L.本文还对高频适配子的产生机制及其应用价值进行了探讨.本文首次筛选出了对哈维氏弧菌具有较高亲和特异性的适配子,为后续利用适配子进行哈维氏弧菌的检测和鉴定奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	宋林生	中国科学院海洋研究所	54	1680	26.0	40.0
2	刘瑞	中国科学院海洋研究所	12	301	6.0	12.0
3	郑江	中国科学院海洋研究所	7	138	5.0	7.0
4	郝聚敏	中国科学院海洋研究所	1	0	0.0	0.0