SELDI技术对开放性脊柱裂胎鼠羊水蛋白质组学的初步分析

• 作者: 刘振江 袁正伟 赵群
• 来源期刊: 中国医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 神经管缺陷 脊柱裂 表面增强激光解析/离子化飞行时间质谱 羊水 蛋白标志物
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 26-30,33
• 页数: 6页
• 分类号: R714.53
• 字数: 2914字
• 语种: 中文

摘要

目的 利用表面增强激光解析/离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术对脊柱裂胎鼠模型的羊水进行初步的蛋白质组学分析.方法 将25只雌性Wistar大鼠随机分为脊柱裂组(n=15)和对照组(n=10).于妊娠第10日(E10)8时,脊柱裂组孕鼠经胃管注入全反式维甲酸与矿物油的混合物(140 mg/kg);对照组孕鼠给予等量的橄榄油.于妊娠第17日(E17)取胎鼠,立体显微镜下抽取羊水(0.2 mL/只)并确定开放性脊柱裂胎鼠.选取60只脊柱裂胎鼠和55只对照组胎鼠的羊水离心取上清.采用PBSⅡC型蛋白质芯片阅读机读取数据.采用Ciphergen protein chip 3.1.1软件对数据进行统计分析.SELDI数据结果采用分类与回归树分析建立诊断模型,用于区分脊柱裂组胎鼠与对照组胎鼠.结果 脊柱裂胎鼠羊水中共检测到55个差异蛋白峰,有统计学意义的差异蛋白峰有9个.包括5种蛋白峰高表达,优化相对分子质量(m/z)分别为11 658,27 387,7 898,11 603,13 831Da;4种蛋白峰低表达,m/z分别为5 124,14 702,5 403,13 626 Da.选取m/z 13 831 Da和m/z 17 798 Da用于建立决策分类树诊断模型,诊断灵敏度93.33％,特异度96.36％,阳性预测值96.55％,阴性预测值96.36％.结论 SELDI技术可初步筛选出脊柱裂胎鼠羊水中的差异蛋白峰,这些蛋白可能是脊柱裂胎鼠羊水中的特异性羊水标志物.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘振江	中国医科大学附属盛京医院小儿外科	30	134	8.0	10.0
2	赵群	中国医科大学附属盛京医院小儿外科	129	582	13.0	16.0
3	袁正伟	中国医科大学附属盛京医院卫生部小儿先天畸形重点实验室	68	191	7.0	11.0