DNA条形码是指利用一段相对较短的标准DNA片段,对物种进行识别和鉴定.目前该技术在动物、植物物种鉴定领域已经得到了广泛的研究和应用.在藻类的研究中,尚未确定一条统一的标准条形码基因,现阶段都是使用2条或2条以上基因序列来完成物种鉴定.对于形态多样、种类繁多的海洋红藻,常用的DNA条形码基因有COI基因(Partialcytochrome c oxidase I gene)、UPA基因(Partial 23S rRNA gene,universal plastid amplicon)、LSU基因(Partial 28S rRNAgene)和rbcL基因(The large subunit of ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase)等,这些基因中2个或3个基因的互补运用准确有效地提高了红藻的鉴定准确率,尤其是COI基因的种间差异大足够区分相近物种.本文在概述条形码的原理及其标准的基础上,阐述了红藻DNA条形码鉴定研究的新进展以及常用几种基因片段的优缺点,并对条形码在红藻鉴定中存在的问题进行了分析,对其应用前景进行了展望.