辣椒转录组SNP挖掘及多态性分析

• 作者: 刘峰 弭宝彬 欧阳娴 茆振川 谢丙炎 谢玲玲 邹学校
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 辣椒 转录组 EST-SNP CAPS
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 343-348
• 分类号: S641.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0513-353X.2014.02.016

摘要

利用SNP分析软件从辣椒(Capsicum annuumL)251 068条Unigenes中筛选出18 159个SNP,其中有1 781个SNP位点被匹配在1 291个注释基因上,基因功能分类和代谢途径分析表明,其中有853个基因参与初生代谢(28.7％)、细胞代谢(17.3％)、生物合成过程(15.7％),另有125个(9.7％)基因序列参与新陈代谢途径,53条(4.1％)序列参与次生代谢产物合成途径,31条(2.4％)序列参与植物激素合成途径.EST-SNP序列中4 172条(22.9％)满足设计CAPS引物条件,为了验证EST-SNP正确性,并选取了15对CAPS引物对5份辣椒材料进行扩增,结果发现有8对(53.3％)引物表现出多态性.表明筛选出这些EST-SNP标记可作为辣椒基因分型、图谱构建等的候选分子标记.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘峰	湖南农业科学院蔬菜研究所	58	275	9.0	14.0
3	谢丙炎	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	175	3639	30.0	51.0
6	邹学校	湖南农业科学院蔬菜研究所	14	108	4.0	10.0
7	茆振川	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	40	564	12.0	22.0
8	谢玲玲	湖南农业科学院西瓜甜瓜研究所	3	52	2.0	3.0
9	弭宝彬	湖南农业科学院蔬菜研究所	1	37	1.0	1.0
10	欧阳娴	湖南农业科学院蔬菜研究所	1	37	1.0	1.0