中华按蚊CYP6Y亚家族基因的鉴定和生物信息学分析

• 作者: 乔梁 唐尧 张玉娟 洪瑞 车燕飞 陈斌
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 中华按蚊 CYP6Y亚家族 基因序列 生物信息学分析 基因结构 相对进化速率
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 所属期刊栏目: 生理与生化
• 页码范围: 663-672
• 分类号: Q966
• 语种: 中文

摘要

[目的]鉴定中华按蚊Anopheles sinensis CYP6Y亚家族基因,分析它们的结构和特征,推测其可能的功能.[方法]以冈比亚按蚊An.gambiae CYP6Y1作为询问序列,通过双向Blast方法检索中华按蚊转录组中CYP6Y亚家族基因,并通过生物信息学方法分析基因结构、特征及可能的功能.[结果]从中华按蚊转录组测序数据中鉴定出2条CYP6Y亚家族基因,分别命名为AsCYP6 Y1(GenBank登录号:KF709397)和AsCYP6Y2(GenBank登录号:KF709398).序列分析显示,As CYP6Y1和AsCYP6Y2全长分别为1 713 bp和1 815 bp,分别编码502和526个氨基酸.基因结构分析显示,该亚家族基因仅含有1个相位1型内含子并与其他P450基因形成保守的共线性分布.蛋白结构分析显示,这2个基因编码的蛋白含P450特有的5个特征序列和6个底物结合位点,且均不存在信号肽,其亚细胞定位为细胞质.3D结构分析显示,AsCYP6Y1有18条α螺旋和13股反向平行的β折叠,AsCYP6Y2有19条α螺旋和11股反向平行的β折叠.通过同样的方法,在达林按蚊An.darlingi中也鉴定出2个CYP6Y亚家族基因.系统进化分析显示,AsCYP6Y1和AsCYP6Y2分别与其他3种按蚊的CYP6Y1和CYP6Y2聚成一支,Bootstrap值均大于90％.替换率分析显示,中华按蚊AsCYP6Y1和AsCYP6Y2与其他3种按蚊同源基因的Ka/Ks均小于1.相对进化速率分析显示,中华按蚊CYP6Y和CYP6M亚家族的相对进化速率均显著快于CYP6P亚家族,而CYP6Y和CYP6M亚家族之间没有显著差异.[结论]在中华按蚊和达林按蚊中存在2个CYP6Y亚家族基因,之前在冈比亚按蚊和不吉按蚊An.funestus中也发现2个CYP6Y亚家族基因,表明CYP6Y亚家族基因可能在按蚊属广泛存在,且可能为按蚊属昆虫所特有.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	乔梁	重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所重庆市动物生物学重点实验室	11	55	3.0	7.0
2	车燕飞	重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所重庆市动物生物学重点实验室	4	15	3.0	3.0
3	张玉娟	重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所重庆市动物生物学重点实验室	19	84	5.0	8.0
4	唐尧	重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所重庆市动物生物学重点实验室	6	12	2.0	3.0
5	洪瑞	重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所重庆市动物生物学重点实验室	3	12	2.0	3.0