文心兰OnCOBRA基因克隆及表达模式分析

• 作者: 李玲 林鹤延 练从龙 赖钟雄 陈裕坤
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 文心兰 COBRA 克隆 生物信息学 qPCR
• 年，卷（期）: 2014,（8）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 1551-1558
• 页数: 8页
• 分类号: S682.31
• 字数: 5515字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2014.08.018

摘要

以文心兰试管苗为材料,采用RT-PCR结合RACE法,克隆文心兰OnCOBRA基因的cDNA全长和DNA序列.结果表明:COBRA全长为1 601 bp,开放阅读框(ORF)为1 386 bp,共编码461个氨基酸;OnCOBRA的DNA序列共2 949 bp,且含有6个外显子和5个内含子.生物信息学结果表明,OnCOBRA属于不稳定的疏水蛋白,具有信号肽、跨膜结构和CCVS保守区域,亚细胞定位于细胞膜中;与无油樟、玉米、籼稻、拟南芥等具有较高的同源性.系统进化树分析结果表明,文心兰OnCOBRA蛋白与玉米(ZmCOBRA)、无油樟(AtCOBRA)、籼稻(OsCOBRA)处于统一分枝,推测OnCOBRA基因是COBRA基因家族的成员.qPCR结果表明,OnCORBA为组成型表达,在成苗期表达量最高,在文心兰类原球茎时期表达量最低.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖钟雄	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	473	4127	31.0	41.0
2	陈裕坤	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	48	97	5.0	7.0
3	练从龙	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	5	23	3.0	4.0
4	李玲	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	1	4	1.0	1.0
5	林鹤延	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	1	4	1.0	1.0