一种基于信息容量的模体比较非比对度量算法

• 作者: 张少强 花季伟 郭丽娟
• 来源期刊: 天津师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 工学
• 关键词: 信息容量 转录因子结合位点 模体 非比对 相似度度量算法
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 页码范围: 32-36
• 页数: 5页
• 分类号: Q819|TP301.6
• 字数: 4741字
• 语种: 中文

摘要

为了有效度量2个模体的相似度,提出一种带有信息容量的用于模体比较的非比对度量算法ICBSN.该算法通过将一个模体的位置频率矩阵在另一个模体的带有信息容量的位置赋权矩阵上滑动,计算出2个模体间的相似度,算法依赖参数少,计算效率高.与其他7种度量法进行比较分析,结果表明:ICBSM可以在数据库查找中更准确地匹配模体,并且能够更有效地聚类相似模体,区分出不相关的模体,为找回模体和分组密切相关模体等方面的研究工作提供有效的计算工具.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭丽娟	天津师范大学计算机与信息工程学院	7	18	1.0	4.0
2	张少强	天津师范大学计算机与信息工程学院	13	15	3.0	3.0
3	花季伟	天津师范大学计算机与信息工程学院	16	43	4.0	5.0